赵一雷

男， 上海交通大学生命科学技术学院， 教授/研究员/教授级高工或同等级别

学习/工作经历

1989.09-1994.06， 中国科技大学 应用化学系， 本科学生
1994.09-1997.06， 北京大学 化学系，硕士研究生
1998.01-2002.04， 香港科技大学 化学系， 博士研究生
2002.10-2005.09， 美国加州大学洛杉矶分校 化学与生物化学系，博士后访问学者
2005.10-2009.04， 美国国家标准技术研究所 化学科学部，外国研究员
2009.05-至今， 上海交通大学 生命科学技术学院， 教授、博士生导师

研究领域和兴趣

计算化学、化学生物学、酶催化、核酸修饰、蛋白质修饰

主要业绩

2002-05年在美国加州大学洛杉矶分校（UCLA）化学与生物化学系从事蛋白质翻译后修饰研究，05-09年在美国国家标准技术研究所（NIST）CSTL标准数据部门工作，曾获UCLA优秀博士后嘉奖、美国INEST Fellowship、上海市浦江人才、上海市“东方学者”特聘教授、教育部新世纪优秀人才。研究领域为计算化学生物学，聚焦酶促催化反应和核酸化学修饰的微观机理解析。提出了酶-底物“预反应态”模型并系统地阐述了DNA硫修饰的结构特征和抗氧化机制。针对微生物生物合成酶系中关键酶开展定向改造，以高效转换高产代谢产物的化学结构。在J. Am. Chem. Soc.、ACIE、Acc. Chem. Res.、Nature Comm.、Mol. Microbiol.、Mol. BioSyst.等期刊发表百余篇peer-reviewed论文

代表成果

1. Jiang, C.; He, B.-B.; Zhao, R. L.; Xu, M.-J.;* Houk, K. N.;* Zhao, Y.-L.* (2021) Computational Exploration of How Enzyme XimE Converts Natural S-Epoxide to Pyran and R-Epoxide to Furan. ACS Cata. 11:7928-7942.
2. Liu, Y., Xu, G., Zhou, J., Ni, J., Zhang, L., Hou, X., Yin, D., Rao, Y., Zhao, Y.-L.,* Ni, Y.* (2020) Structure-guide engineering of D-carbamoylase reveals a key look at substrate entrance tunnel. ACS Catalysis, 10(21):12393-12402.
3.Huang, Q.; Li, J.; Shi, T.; Liang, J.; Wang, Z.; Bai, L.; Deng, Z.; Zhao, Y.-L.* (2020) “The defense mechanism of phosphorothioated DNA under peroxynitrite-mediated oxidative stress” ACS Chemical Biology. 15(9):2558–2567.
4.Yu, H.; Li, J.; Liu, G.; Zhao, G.; Wang, Y.; Hu, W.; Deng, Z.; Wu, G.; Gan, J.; Zhao, Y.-L. * and He, X.* (2020) “DNA backbone interactions impact the sequence specificity of DNA sulfur-binding domains: revelations from structural analyses” Nucleic Acids Research, 48(15):8755-8766.
5.Liang, B.; Gao, Y.; Xu, J.; Song, Y.; Xuan, L.; Shi, T.; Wang, N.; Hou, Z.; Zhao, Y.-L.;* Huang, W.H.; Chen, Z.J. (2019) “Raman Profiling of Embryo Culture Medium to Identify Aneuploid and Euploid Embryos” Fertl. & Steril. 1111（4）：753-762.
6.He, B.-B.; Zhou, T.; Bu, X.-L.; Weng, J.-Y.; Xu, J.; Lin, S.-J.; Zheng, J.-T.;* Zhao, Y.-L.;* Xu, M.-J.* (2019) “Enzymatic Pyran Formation Involved in Xiamenmycin Biosynthesis” ACS Catalysis, 9(6): 5391-5399
7.Nie, Y.; Wang, S.; Xu, Y.; Luo, S.; Zhao, Y.-L.;* Xiao, R.;* Montelione, G.; Hunt, J.; Szyperski, T. (2018) “Enzyme engineering based on X-ray structures and kinetic profiling of substrate libraries: alcohol dehydrogenases for stereospecific synthesis of a broad range of chiral alcohols” ACS catalysis. 8, 5145−5152.
8.Shi, T.; Liu, L.; Tao, W.; Luo, S.; Fan, S.; Wang, X.-L.; Bai, L.; Zhao, Y.-L.* (2018) “Theoretical studies on the catalytic mechanism and substrate diversity for macrocyclization of pikromycin thioesterase” ACS catalysis. 2018, 8, 4323−4332.
9.Chen, X.-P.; Shi, T.; Wang, X.-L.; Wang, J.; Chen, Q.; Bai, L.; Zhao Y.-L.* (2016) “Theoretical studies on the mechanism of thioesterase-catalyzed macrocyclization in erythromycin biosynthesis” ACS catalysis. 6, 4369-4378.

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