王任小

男， 复旦大学药学院药物化学系， 教授/研究员/教授级高工或同等级别

学习/工作经历

1989.09 – 1994.07 北京大学化学与分子工程学院, 物理化学专业，理学学士
1994.09 – 1999.07 北京大学化学与分子工程学院, 物理化学专业，理学博士
1999.09 – 2000.08 美国加州大学洛杉矶分校化学系, 博士后
2000.09 – 2001.08 美国乔治敦大学医学院，博士后
2001.09 – 2005.07 美国密西根大学医学院，research investigator
2005.08 – 2019.12 中国科学院上海有机化学研究所，生命有机化学国家重点实验室，研究员
2020.01 – 至今 复旦大学药学院，特聘研究员

研究领域和兴趣

计算药物化学；人工智能药物设计

主要业绩

擅长发展分子靶向药物设计的新理论、新方法，为药物研发提供更好的工具。代表性成果有对蛋白-配体相互作用打分函数的研究、蛋白-配体复合物数据库、配体分子的自动设计方法等。所发展的药物设计软件在60多个国家拥有6500余名注册用户，其中许多来自国际著名的大学、研究所以及大型医药公司，形成了广泛的国际影响，近5年来被他人成功应用达400余次。同时，本人亦注重在实践中应用药物设计技术，选择Bcl-2家族等蛋白-蛋白作用体系作为靶标，成功获得了若干类抗肿瘤活性先导化合物。
学术生涯已发表SCI索引论文120余篇，SCI他人引用总数超过6000次（H指数为34），并获得国家发明专利授权和软件著作权30项。近年来曾先后获得药明康德“生命化学研究奖”、中国化学会“青年计算化学家奖”、中国药学会“施维雅青年药物化学家”等多项国内知名奖项，并于2012年获得国际化学信息学会“Corwin Hansch Award”，系中国科学家首次获得这一国际知名奖项。目前担任中国化学会计算机化学专业委员会副主任委员、生物物理化学专业委员会副主任委员、化学生物学专业委员会委员、以及上海市药学会药物化学专业委员会委员。受邀担任美国化学会Journal of Chemical Information and Modeling杂志副主编以及ChemMedChem、Molecular Informatics、《中国药学》等国内外多家刊物编委。2017年获得国家自然科学基金委医学部“国家杰出青年”科学基金项目资助。

代表成果

（1）Liu, Z. H.; Su, M. Y.; Han, Li.; Liu, J.; Yang, Q. F.; Li, Y.;* Wang, R.-X.* " Forging the Basis for Developing Protein−Ligand Interaction Scoring Functions", Acc. Chem. Res. 2017, 50(2), 302–309.
（2）Li, Y.; Su, M. Y.; Liu, Z. H.; Li, J.; Liu, J.; Han, L.; Wang, R. X.* "Assessing Protein-Ligand Interaction Scoring Functions with the CASF-2013 Benchmark", Nat. Protocol., 2018, 13, 666-680. doi:10.1038/ nprot.2017.114.
（3）Su, M. Y.; Yang, Q. F.; Du, Y.; Feng, G. Q.; Liu, Z. H.; Li, Y.;* Wang, R. X.* “Comparative Assessment of Scoring Functions: The CASF-2016 Update”, J. Chem. Inf. Model. 2019, 59, 895−913 (cover story).
（4）Su, M. Y.; Feng, G. Q.; Liu, Z. H.; Li, Y.; Wang, R. X.* “Tapping on the Black Box: How is the Scoring Power of a Machine-Learning Scoring Function Depended on the Training Set?”, J. Chem. Inf. Model. 2020, 60(3), 1122-1136. doi.org/10.1021/ acs.jcim.9b00714
（5）Li, Y.;* Sun, Y. P.; Song, Y. P.; Dai, D. C.; Zhao, Z. X.; Zhang, Q.; Zhong, W. G.; Hu, L. Y.; Ma, Y. L.; Li, X.;* Wang, R. X.* “Fragment-Based Computational Method for Designing GPCR Ligands”, J. Chem. Inf. Model. 2020, 60(9), 4339−4349. doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00699 (cover story)
（6）Du, Y.; Wang, R. X.* “Revealing the Unbinding Kinetics and Mechanism of Type I and Type II Protein Kinase Inhibitors by Local-Scaled Molecular Dynamic Simulations”, J. Chem. Theory Comput. 2020, 16(10), 6620−6632.
（7）Yang, Q. F.; Qiu, X. X.; Zhang, X. Z.; Yu, Y. T.; Li, N.; Wei, X.; Feng, G. Q.; Li, Y.; Zhao, Y. X.*; Wang, R. X.* “Optimization of Beclin 1-Targeting Stapled Peptides by Staple Scanning Leads to Enhanced Antiproliferative Potency in Cancer Cells”, J. Med. Chem. 2021, 64(18), 13475–13486. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.1c00870
（8）Li, Y.; Fan, W. J.; Gong, Q. N.; Tian, J.; Zhou, M.; Li, Q.; Uwituze, L. B.; Zhang, Z. C.*; Hong, R.*; Wang, R. X.* “Structure-Based Optimization of 3-phenyl-N-(2-(3-phenylureido)ethyl)thiophene-2-sulfonamide Derivatives as Selective Mcl-1 Inhibitors”, J. Med. Chem. 2021, 64(14),10260-10285. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.1c00690
（9）Feng, G. Q.; Zhang, X. Y.; Li, Y.*; Wang, R. X.* “Analysis of the Binding Sites on BAX and the Mechanism of BAX Activators Through Extensive Molecular Dynamics Simulations”, J. Chem. Inf. Model. 2022, 62(21), 5208−5222. DOI: 10.1021/acs.jcim.0c01420
（10）Xiang, H. G.; Liu, R. Q.; Zhang, X. Y.; An, R.; Zhou, M.; Tan, C.; Li, Q.; Su, M. Y.; Guo, C.; Zhou, L.;* Li, Y. X.;* Wang, R. X.* “Discovery of Small-Molecule Autophagy Inhibitors by Disrupting the Protein-Protein Interactions Involving ATG5”, J. Med. Chem. 2023, 66(4), 2457–2476. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.2c01233
（11）Qiu, X. X.; Li, N.; Yang, Q. F.; Wu, S.; Li, X. H.; Pan, X. H.; Yamamoto, S.; Zhang; X. Z.; Zeng, J. C.; Liao, J. H.; He, C. C.; Wang, R. X.*; Zhao, Y. X.* “The potent BECN2-ATG14 coiled-coil interaction is selectively critical for endolysosomal degradation of GPRASP1/GASP1-associated GPCRs”, Autophagy, 2023, 19(11), 2884-2898. DOI: 10.1080/15548627.2023.2233872
（12）Li, Y.*; Zhang, Z.; Wang, R. X.* “HydraMap v.2: Prediction of Hydration Sites and Desolvation Energy with Refined Statistical Potentials”, J. Chem. Inf. Model., 2023, 63(15), 4749–4761; DOI: 10.1021/acs.jcim.3c00408.
（13）Xiang, H. G.; Zhou, M.; Li, Y.; Zhou, L.*; Wang, R. X.* “Drug discovery by targeting the protein‒protein interactions involved in autophagy”, Acta Pharm. Sinica B, 2023, 13(11), 4373-4390. DOI: 10.1016/j.apsb.2023.07.016
（14）Zhang, X. Y.; Gao, H. T.; Wang, H. J.; Chen, Z. H.; Zhang, Z.; Chen, X. C.; Li, Y.; Qi, Y. F.*; Wang, R. X.* “PLANET: A Multi-objective Graph Neural Network Model for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction”, J. Chem. Inf. Model., 2024, 64(7), 2205–2220. DOI: 10.1021/acs.jcim.3c00253
（15）Chen, Z. H.; Ji, M. L.; Qian, J.; Zhang, Z.; Zhang, X. Y.; Wang, H. J.; Gao, H. T.; Wang, R. X.*; Qi, Y. F.* “ProBID-Net: A Deep Learning Model for Protein-Protein Binding Interface Design”, Chem. Sci., 2024, 15, 19977-19990. DOI: 10.1039/D4SC02233E

*以上信息由高级会员个人更新和维护。