巫瑞波

男， 中山大学， 教授/研究员/教授级高工或同等级别

学习/工作经历

2002.02-2006.07，厦门大学化学系，本科
2006.09-2010.12，厦门大学化学系，博士
2011.04-2011.10，美国纽约大学化学系，博士后
2011.11-2016.12，中山大学药学院，副教授
2017.01-至今，中山大学药学院，教授

研究领域和兴趣

研究方向为萜类多尺度模拟。主要围绕萜类天然产物的生物合成、生物功能和生物活性等相关问题开展多尺度模拟研究, 借助量子-经典(QM/MM)力学方法、分子动力学(MD)模拟、大数据挖掘和深度学习等策略, 开发数据库和算法，解析酶催化等分子机制, 并结合实验验证开展蛋白活性改造和抑制剂设计。

主要业绩

迄今发表SIC论文60余篇（通讯作者身份发表的IF>10论文有10余篇）。主持科研基金10项，包括国自然面上项目2项、青年基金1项，以及广东省杰出青年基金等。更多情况请查看课题组主页：http://www.qmclab.com/。

代表成果

(1) Tao Zeng#; Zhihong Liu#; Jingyuan Zhuang; Yitao Jiang; Wengan He;
Hongjuan Diao; Nan Lv; Yongxing Jian; Danhong Liang; Yufan Qiu; Rong Zhang; Fan
Zhang; Xiaowen Tang; Ruibo Wu*; TeroKit: A Database-Driven Web Server for
Terpenome Research , Journal of Chemical Information and Modeling, 2020, 60(4)
: 2082-2090.
(2) Kai Wang#; Nan Lyu#; Hongjuan Diao; Shujuan Jin; Tao Zeng; Yaoqi Zhou*;
Ruibo Wu*; GM-DockZn: a geometry matching-based docking algorithm for zinc
proteins , Bioinformatics, 2020, 36(13): 4004-4011.
(3) Xiaowen Tang; Fan Zhang; Tao Zeng; Wei Li; Sheng Yin*; Ruibo Wu*; Enzyma
tic Plasticity Inspired by the Diterpene Cyclase CotB2 , ACS Chemical Biology,
2020, 15(10): 2820-2832.
(4) Yong-Heng Wang; Fan Zhang; Hongjuan Diao; Ruibo Wu*; Covalent
Inhibition Mechanism of Antidiabetic Drugs—Vildagliptin vs Saxagliptin, ACS
Catalysis, 2019, 9(3): 2292-2302.
(5) Nanhao Chen; Shenglong Wang; Lidia Smentek; B. Andes Hess, Jr.,*; Ruibo
Wu*; Biosynthetic Mechanism of Lanosterol: Cyclization, Angewandte Chemie
International Edition, 2015, 54(30): 8693-8696.
(6) 巫瑞波; 周经纬; 顾琼; 一种beta-取代查尔酮类似物及其制备方法和在制备组蛋
白去乙酰化酶抑制剂中的应用, 2016-06-08, 中国, ZL201310618498.3. (专利)
(7) 巫瑞波; 王凯; 一种基于最优几何匹配的锌酶对接方法, 2019-8-20, 中国, 专利
申请号201910293888.5. (专利)
(8) 巫瑞波; 曾涛; 萜类化合物检索与分析平台[简称：TeroKit]V1.0, 2020SR006234
3, 原始取得, 全部权利, 2019-12-1. (软件著作权)
(9) 巫瑞波; 何文淦; 芳香堆积分析软件[简称： AromTool]V1.0, 2020SR0826892,
原始取得, 全部权利, 2020-5-1. (软件著作权)
（10）2018-6-7至2018-6-10, 举办第二届世界华人计算生物和分子模拟大会
（巫瑞波作为会议总负责人）, 广州, 中山大学药学院承办。

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