林世贤

男， 浙江大学， 教授/研究员/教授级高工或同等级别

学习/工作经历

2005-2009　武汉大学，学士

2009-2014 北京大学，博士

2014-2017 加州大学伯克利分校，博士后

2017- 今 浙江大学生命科学研究院研究员、博士生导师

研究领域和兴趣

蛋白质翻译的化学生物学、合成生物学

主要业绩

林世贤博士在蛋白质翻译的化学生物学领域取得了显著成果，提出了嵌合翻译系统和稀有密码子重编码系统等原创技术，成功利用非天然氨基酸体系编码、识别和发现新型功能蛋白质翻译后修饰，进而开发新型生物医药。研究成果以（共同）通讯作者在Science（2024）、Nat Cell Biol（2023）、Nat Chem（2024）、Nat Struct Mol Biol（2023a，2023b）、Nat Chem Biol（2023）、Chem Rev（2024）、Acc Chem Res（2023）、Nat Commun（2020，2021）、J Am Chem Soc（2022，2023）、ACS Cent Sci（2024）等国际一流学术期刊上，累计发表论文十余篇。同时，作为第一发明人申请了生物医药相关发明专利十余项，其中五项已成功转让，并与生物医药企业开展了多项横向合作。
 
主要学术贡献包括：
学术成绩一：提出正交移植策略，构建嵌合体翻译系统，实现了包括脂化修饰在内的多种翻译后修饰的高效遗传编码，深入探索了精准脂化修饰的生物学功能及其在生物医药领域的应用。

学术成绩二：提出稀有密码子重编码策略用于遗传编码非天然氨基酸，有效克服了传统依赖终止密码子策略的低效率缺陷，在哺乳动物细胞和大肠杆菌中高效合成各种功能蛋白质，并展示了其在基础和转化研究中的应用。

学术成绩三：利用蛋白质翻译化学生物学技术，作出了多项原创生物学发现：包括发现细胞中存在新型氨酰化赖氨酸泛素化修饰，并揭示了新修饰在促进蛋白质降解方面的功能及特异的书写酶；解析了糖基化修饰对YTHDF蛋白的翻译促进功能与相分离性质的调控机制；并通过广泛合作，证明研究体系适用于系列翻译后修饰的获得性功能研究。

学术成绩四：通过建立的蛋白质翻译化学生物学技术平台，已与数十家实验室开展深入合作，取得了一系列重要研究成果，充分证明了该技术平台在蛋白质翻译后修饰研究中的广泛应用价值。

代表成果

1. Gu J, Lao L, Hu L, Zang J, Liu C, Wan R, Tang L, Yuan Y*, Chen Y*, Lin S*. “Nascent liver proteome reveals enzymes and transcription regulators under physiological and alcohol exposure conditions”, Nat. Commun., 2025, 16, 7945.
2. Ding W, Yu W, Chen Y, Lao L, Fang Y, Fang C, Zhao H, Yang B, Lin S*. “Rare codon recoding for efficient noncanonical amino acid incorporation in mammalian cells”, Science, 2024, 384, 1134-1142.
3. Zhu Y, Ding W, Chen Y, Shan Y, Liu C, Fan X*, Lin S*, Chen PR*. “Genetically encoded bioorthogonal tryptophan decaging in living cells”, Nat. Chem., 2024, 16, 533-542.
4. Ding W, Liu C, Chen Y, Gu J, Fang C, Hu L, Zhang L, Yuan Y, Feng XH, Lin S*. “Computational design and genetic incorporation of lipidation mimics in living cells”, Nat. Chem. Biol., 2024, 20, 42-51.
5. Chen Y, Wan R, Zou Z, Lao L, Shao G, Zheng Y, Tang L, Yuan Y, Ge Y*, He C*, Lin S*. “O-GlcNAcylation determines the translational regulation and phase separation of YTHDF proteins”, Nat. Cell Biol., 2023, 25, 1676-1690.
6. Zhao H, Tang L, Fang Y, Liu C, Ding W, Zang S, Chen Y, Xu W, Yuan Y, Fang D, Lin S*. “Manipulating cation-π interactions of reader proteins in living cells with genetic code expansion”, J. Am. Chem. Soc., 2023, 145, 16406-16416.
7. Zang J, Chen Y, Liu C, Hu L, Zhao H, Ding W, Yuan Y, Lin S*. “Genetic code expansion reveals aminoacylated lysine ubiquitination mediated by UBE2W”, Nat. Struct. Mol. Biol., 2023, 30, 62-71.
8. Zhao H, Liu C, Ding W, Tang L, Fang Y, Chen Y, Hu L, Yuan Y, Fang D, Lin S*. “Manipulating cation-π interactions with genetically encoded tryptophan derivatives”, J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 6742-6748.
9. Zhao H, Ding W, Zang J, Yang Y, Liu C, Hu L, Chen Y, Liu G, Fang Y, Yuan Y, Lin S*. “Directed-evolution of translation system for efficient unnatural amino acids incorporation and generalizable synthetic auxotroph construction”, Nat. Commun., 2021, 12, 7039.
10. Ding W, Zhao H, Chen Y, Zhang B, Yang Y, Zang J, Wu J, Lin S*. “Chimeric design of pyrrolysyl-tRNA synthetase/tRNA pairs and canonical synthetase/tRNA pairs for genetic code expansion”, Nat. Commun., 2020, 11, 3154.

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